Центр духовного развития детей и молодежи был создан в 1999 году при Московском Даниловом монастыре с целью организации церковной миссионерской, катехизической, духовно-просветительской и социальной деятельности среди различных слоев населения столицы и прежде всего в детской и молодежной среде.
В 2001 году при Центре была организована Школа молодежного служения.
В марте 2004 года центр духовного развития за успешные труды в области духовно-нравственного воспитания и социально-культурного просвещения детей и молодежи и как знак особого покровительства патриарха получил статус Патриаршего.
Работа Центра строится по следующим направлениям:
духовно-нравственное просвещение и образование;
социально-психологическая помощь и поддержка молодежи;
поддержка и развитие педагогических и социальных инициатив;
аналитическая и методическая работа;
вспомогательная деятельность.
На 2012 год в центре трудились около 150 профессиональных сотрудников и добровольных помощников, деятельность Центра включала 36 различных миссионерских, просветительских и социальных проектов. Общее число участников всех программ составляла более 10 тысяч человек в год, подавляющее большинство из которых молодежь.